紅光雷射筆與綠光雷射筆除了價格差異較大外，綠光雷射筆波長較短，因此照射較遠且較亮，價格從500~10000都有，較適合使用在大型會議或演講場合，或是需在白天或較亮的場合下使用雷射筆才需用綠光，如建築指示或工程指引或旅遊導覽等。綠光雷射筆也適合如醫師要在X光投影片上指示，光點較為明顯，若是紅光則容易因吸光而不明顯，另外，若您的會議室的簡報屏幕是液晶電視或是其它易吸光的材質，則同樣使用綠光雷射筆才會明顯。

另外，由於綠光雷射筆射程遠且亮，若功率高達20mW以上，則可看見光束，因此亦適合觀測星象或登山者。但目前市面市有些業者販售劣質20~30mW功率，價格不到1000元，則需小心。

要注意的是10mW以上的高功率綠光雷射筆是有危險性的，若照射眼睛會有危險，若是50mW以上者，直射可將火柴點燃，因此相當危險，也不利於飛航安全，而高功率雷射筆在歐洲則是完全禁用的。